A colonoscopia comum é geralmente mais profunda na região ileocecal ou na extremidade do íleo e, no caso da colonoscopia pequena, a endoscopia por cápsula, etc., também pode examinar o intestino delgado. Existem muitos tipos diferentes de colonoscópios, incluindo a colonoscopia por fibra ótica, a endoscopia por cápsula, a colonoscopia pequena com balão simples ou duplo, etc. A colonoscopia comum geralmente examina lesões do cólon e do reto, principalmente usando colonoscopia eletrônica de fibra ótica, que entra pelo ânus e na extremidade ileocecal ou ileocecal, e a observação colonoscópica de lesões colorretais é realizada principalmente no momento da decanalização. No caso dos pequenos enteroscópios de balão simples ou duplo, o acesso à parte superior do intestino delgado é necessário através da boca, sendo necessária uma segunda operação para entrar pelo ânus e alcançar a parte inferior do intestino delgado através da válvula ileocecal, a fim de completar o exame de todo o intestino delgado. No caso da endoscopia por cápsula, esta é engolida pela boca, passa pelo estômago, pelo intestino delgado, pelo colo-rectal e sai pelo ânus. Geralmente, de acordo com as diferentes condições e as necessidades do doente, serão escolhidos diferentes modos de colonoscopia. Aconselha-se os doentes a pesar os prós e os contras e, em seguida, a escolher de forma razoável.