A diferença entre a gastroscopia eletrónica e a gastroscopia por ultra-sons reside principalmente nos diferentes locais e objectivos da observação. A gastroscopia eletrónica é utilizada principalmente para a observação direta de doenças da mucosa para fazer o exame, como a úlcera gástrica, a gastrite crónica, a erosão gástrica superficial, etc.; a gastroscopia eletrónica pode observar o esófago, o estômago, a mucosa do duodeno e outras partes das lesões, geralmente não consegue ver as lesões da submucosa. E a gastroscopia por ultra-sons baseia-se no gastroscópio e na utilização de um scanner de sonda de ultra-sons, geralmente utilizado para observar o material da submucosa, a utilização direta da gastroscopia não permite observar as lesões. A gastroscopia por ultra-sons pode ajudar a esclarecer a natureza da massa submucosa. Além disso, a endoscopia por ultra-sons pode ajudar no diagnóstico de doenças como os tumores pancreáticos e as massas abdominais. Recomenda-se a escolha de um hospital regular para o exame e, se necessário, pode ser realizada uma punção guiada através da endoscopia por ultra-sons para determinar a natureza da lesão.