Quando a atrofia do nervo ótico ocorre, não existe atualmente um bom tratamento para a recuperar, mas pode ser utilizado um tratamento para retardar o mais possível a progressão da atrofia do nervo ótico. A atrofia do nervo ótico é geralmente causada pela degeneração e apoptose das células ganglionares da retina, resultando em perda de visão e defeitos no campo visual. A atrofia do nervo ótico é irreversível e, uma vez ocorrida, não pode ser totalmente recuperada através de tratamento. A chave para o tratamento nesta fase é descobrir a causa da atrofia do nervo ótico e, em seguida, eliminar a causa para evitar o agravamento da condição. Por exemplo, para a atrofia do nervo ótico causada por glaucoma, devem ser utilizadas gotas de brinzolamida para baixar a pressão intraocular e parar a progressão da doença, enquanto a atrofia do nervo ótico causada pela neuropatia ótica isquémica pode ser tratada injectando cotrimoxazol junto à artéria temporal superficial. A atrofia do nervo ótico deve ser tratada rapidamente, com a medicação prescrita pelo médico, para preservar a visão o mais possível.