As infecções intestinais só são tratadas com antibióticos se se considerar que são causadas por infecções bacterianas. Os antibióticos de largo espetro, como as cefalosporinas, devem ser utilizados antes da colheita de culturas de fezes e, em seguida, deve ser administrado um tratamento específico após a obtenção das culturas de fezes. As infecções intestinais incluem principalmente infecções bacterianas e infecções virais, que têm de ser combinadas com manifestações clínicas e testes de cultura de fezes para fazer um diagnóstico claro. Se a infeção bacteriana do trato intestinal, muitas vezes causada pela ingestão de alimentos não limpos e outros factores, o doente pode manifestar febre, dor abdominal, diarreia, etc., na ausência de cultura de fezes pode ser utilizada ceftazidima, ornidazol, etc. para tratamento. Após a cultura de fezes, as bactérias sensíveis são utilizadas para o tratamento. Os médicos precisam de combinar a história clínica, a análise sanguínea, etc. para determinar a causa da doença do doente, pelo que não devem utilizar arbitrariamente o tratamento com antibióticos. Recomenda-se que o doente se dirija atempadamente ao hospital quando sentir algum desconforto e que trate ativamente a doença sob a orientação de médicos profissionais.