A neurose gastrointestinal pode ser regulada a partir do aspeto mental, como o exercício de fortalecimento, o relaxamento e a medicação, como os medicamentos anti-ansiedade e os medicamentos supressores de ácido. A neurose gastrointestinal é maioritariamente causada por tensão mental e secundária a uma série de doenças digestivas, como a gastrite e a úlcera péptica. Por conseguinte, o tratamento pode começar pela melhoria do estado mental e pela correção das doenças do aparelho digestivo. Os doentes podem reforçar o exercício, relaxar, participar em actividades sociais e comunicar com os outros para melhorar o estado mental de ansiedade e tensão. Se necessário, podem ser administrados fármacos ansiolíticos, como o diazepam, para desempenhar o efeito de anti-ansiedade, sedação, sono, etc. Para doenças do aparelho digestivo, principalmente devido ao aumento da secreção de ácido gástrico, podem ser administrados medicamentos supressores de ácido, como omeprazol, ranitidina, a medicação deve seguir as instruções do médico.