A ciclofosfamida (CTX) é útil no tratamento de doenças do tecido conjuntivo como a lupus nephritis e a vasculite sistémica, mas é importante monitorizar os efeitos tóxicos. Os efeitos secundários agudos incluem náuseas, vómitos, diarreia, alopecia, baixo teor de sódio e mielo-toxicidade reversível, tais como diminuição dos leucócitos sanguíneos e plaquetas, mas a recuperação começa normalmente após 2 semanas. Os efeitos tóxicos comuns da utilização a longo prazo são: 1. tumores malignos: há uma correlação com a dose total de CTX, e a hipótese de tumores ocorrerem acima dos 30 g é significativamente aumentada, sobretudo tumores malignos do tracto urinário, medula óssea e pele; 2. cistite hemorrágica: geralmente ocorre após a administração oral de CTX, e a maioria das pessoas não bebe muita água depois de tomar a droga. Algumas pessoas acreditam que a hipótese de tumores na bexiga aumenta significativamente após a ocorrência de cistite hemorrágica, pelo que se chama lesão pré-cancerígena; 3, toxicidade reprodutiva: após a aplicação de CTX nas mulheres, especialmente após a meia-idade, pode levar à falência ovariana, manifestada como amenorreia, esterilidade, e nas mulheres grávidas, pode também aparecer fetos anormais; e nos homens, a formação de atrofia testicular, perda de líbido, azoospermia ou fraqueza espermática; 4, infecção. Como o CTX pode levar a uma diminuição da imunidade do corpo, é fácil formar várias infecções bacterianas e virais, especialmente algumas infecções oportunistas. Como mencionado acima, o CTX tem alguns efeitos secundários tóxicos graves, mas não deve ser descartado como tal. A gestão correcta desta contradição depende de um controlo rigoroso das indicações e da observação atenta dos vários efeitos tóxicos.