Existe uma ligação directa entre otite média e palato fendido. As crianças com palato fendido têm uma probabilidade muito maior de desenvolver otite média do que as pessoas normais porque existe uma passagem do ouvido médio dentro do ouvido para a garganta chamada trompa de Eustáquio. A trompa de Eustáquio permite que as secreções do ouvido médio drenem para a garganta e mantém o equilíbrio da pressão entre o lado interno e externo do tímpano. Em pacientes com palato fendido, o palato é defeituoso e os músculos do palato mole não estão devidamente distribuídos, o que faz com que a abertura e fecho faríngeo da trompa de Eustáquio funcione mal e cria uma pressão negativa no ouvido médio, de modo que o problema do fluido no ouvido médio (também conhecido como otite média exsudativa) surge frequentemente. De acordo com as estatísticas, o fluido no ouvido médio é uma complicação comum em até 95% dos pacientes com fenda palatina por volta de 1 ano de idade. Os principais sintomas de fluido no ouvido médio são perda auditiva ou uma sensação de inchaço no ouvido. No entanto, como a maioria das crianças pequenas não o expressam, os pais normalmente não o notam. A menos que o fluido se infecte e se torne um meio de otite supurativa aguda, haverá febre ou descarga do canal auditivo. Por vezes, as crianças podem coçar os ouvidos porque se sentem desconfortáveis, por isso é importante estar atento a quaisquer problemas auditivos. Se a otite média não for tratada, o tímpano cicatrizará e endurecerá com o tempo. Se isto for combinado com otite média supurativa frequente, os danos no tímpano tornar-se-ão mais graves e causarão perda auditiva permanente, o que, por sua vez, afectará o desenvolvimento anormal da fala e da voz. Os otorrinolaringologistas podem utilizar um otoscópio para examinar a membrana timpânica em busca de anomalias ou realizar um teste auditivo para ver se existe uma deficiência auditiva. Um timpanograma também pode ser realizado para detectar lesões precoces do ouvido médio. O tratamento é conservador ou pode ser combinado com uma reparação do palato fendido, onde um cateter do ouvido médio é colocado sob anestesia geral para encorajar a drenagem de qualquer plasma ou muco que se tenha acumulado na cavidade do ouvido médio. É aconselhável evitar água no canal auditivo após a cirurgia para evitar otite média purulenta. O tubo do ouvido médio costuma drenar automaticamente da membrana timpânica dentro de um ano, mas algumas pessoas podem sofrer uma recorrência de fluido no ouvido médio como resultado e precisam de ser tratadas novamente.