Dependendo da composição das pedras, as pedras urinárias podem ser divididas em seis categorias: pedras de oxalato de cálcio, pedras de fosfato de cálcio, pedras de ácido úrico (urato), pedras de fosfato de amónio e magnésio, pedras de cistina e pedras purínicas. A maioria das pedras pode ser uma mistura de dois ou mais componentes. As características de cada pedra são as seguintes: as pedras de oxalato de cálcio têm urina ácida e caracterizam-se por uma cor dura, inquebrável, rugosa, irregular, acastanhada. As pedras de fosfato de cálcio são alcalinas na urina, caracterizadas por friáveis, grosseiras, irregulares, acinzentadas, amarelas ou castanhas, frequentemente causadas por infecções e obstruções do tracto urinário. As pedras de ácido úrico são persistentemente ácidas na urina e caracterizam-se por uma cor dura, lisa, granular, amarela ou vermelha acastanhada e um metabolismo anormal do ácido úrico. As pedras de fosfato de amónio magnésio são infecções renais, caracterizadas por corpos lisos, facetados ou vertebrais, na sua maioria associados à dieta. As pedras cistina são doenças genéticas raras, caracterizadas por uma cor dura, lisa, cerosa, amarelada a castanha-amarelada, devido à herança familiar.