As manifestações clínicas da sífilis são tão variadas que é conhecida como um mestre da mímica e é facilmente esquecida ou mal diagnosticada clinicamente, variando desde manifestações cutâneas e de mucosas a danos cardiovasculares e neurológicos. Alguns pacientes não têm manifestações clínicas mas têm um teste serológico positivo, conhecido como sífilis latente. A sífilis precoce é classificada de acordo com o estádio de infecção, e a sífilis precoce se a doença tiver menos de dois anos, e a sífilis tardia se tiver mais de dois anos de idade. A sífilis precoce é dividida em fase 1 e fase 2 sífilis em doentes sintomáticos. Os sintomas proeminentes da sífilis de fase 1 são o cancre duro e a sífilis cruzada. O chancre duro refere-se a uma reacção inflamatória no local da invasão espiroqueta, manifestando-se como eritema, erosões ou úlceras superficiais, geralmente solitárias e sem sintomas conscientes. A técnica sifilítica refere-se aos gânglios linfáticos aumentados perto do canal duro que não se tornam purulentos, são duros e duram muito tempo. A fase 2 da sífilis ocorre 6 a 12 semanas após o aparecimento do chancre duro e encontra-se principalmente na pele e nas membranas mucosas, e ocasionalmente nos ossos e nervos. Alguns pacientes têm frequentemente sintomas sistémicos antes do início da erupção cutânea, tais como dores de cabeça, febre baixa, mal-estar geral, dores nas articulações, perda de apetite e amígdalas aumentadas. A sífilis de fase II tem uma variedade de manifestações e pode imitar os danos de várias doenças de pele, com falta de sintomas auto-conscientes, e pode diminuir por si só sem tratamento, tornando fácil o diagnóstico clínico incorrecto. A sífilis de fase III pode apresentar manifestações de pele e mucosas, e pode também invadir os sistemas cardiovascular e nervoso. Nos últimos anos, devido ao uso generalizado de antibióticos, as manifestações cutâneas e mucosas típicas da sífilis de fase III tornaram-se raras. A sífilis cardiovascular pode apresentar aortite sifilítica, atresia aórtica, aneurisma aórtico, arterite coronária sifilítica e miocardite. A sífilis neurológica, que pode causar consumo espinal e demência paralítica generalizada, também pode apresentar acidentes cerebrovasculares e meningite.