Mais de 90% dos pacientes com neurosífilis podem ter algum sucesso clínico com tratamento apropriado, mas aqueles com neurosífilis complicados pela atrofia do nervo óptico resultando em cegueira têm menos probabilidades de recuperar a sua visão. A neurosífilis também pode levar a AVC, meningite, perda de audição, visão anormal, demência, e pode resultar em perda de dor e sensação de temperatura, bem como disfunção sexual masculina e incontinência da bexiga. A sífilis do estágio 3 é uma manifestação da sífilis do estágio 1 ou estágio 2. Se a sífilis do estágio 1 ou estágio 2 não for tratada ou for tratada de forma inadequada, a sífilis do estágio 3 pode ocorrer em 40% dos doentes após 3-4 anos. Embora esta fase seja menos contagiosa, é muito destrutiva e para além de danos na pele e mucosas, pode ocorrer sífilis esquelética, sífilis cardiovascular e sífilis neurológica.