A forma mais eficaz de tratar e prevenir a trombose séptica é tratá-la e preveni-la com base na patogénese da sepsis, mas infelizmente a patogénese da trombose séptica ainda não é totalmente compreendida. Neste caso, o trabalho de prevenção deve ser feito em todos os aspectos da prática clínica para abordar a patogénese, e os esforços para reduzir os factores de risco que predispõem à infecção desempenham um papel importante no tratamento e prevenção da trombose séptica. Uma nutrição enteral precoce e agressiva, uma melhor modulação metabólica e imunológica, e uma melhor protecção e apoio à função multi-orgânica são ferramentas importantes na prevenção e tratamento da trombose séptica. A alimentação gastrointestinal precoce pode efectivamente manter a função de barreira da mucosa intestinal, fornecer proteínas e calorias suficientes, promover o equilíbrio positivo do azoto, reduzir as reacções hipermetabólicas, melhorar a imunidade do corpo, e prevenir e reduzir a ocorrência de infecções sistémicas. A monitorização do débito urinário para assegurar a perfusão renal, urina alcalinizante apropriada e diurese pode proteger a função renal. Para alguns doentes com creatinina sanguínea e azoto ureico muito elevados e indicações claras de diálise, a hemofiltração precoce e a terapia de substituição renal podem ser administradas para interromper o desenvolvimento de MOF numa fase precoce.