É geralmente aceite que o GIST é um tumor potencialmente maligno e embora a cirurgia seja o tratamento de escolha para o GIST primário ressecável, a taxa de sobrevivência de 5 anos para pacientes com GIST após a ressecção completa da lesão é apenas de cerca de 50% e menos de 10% para pacientes com ressecção incompleta antes do medicamento alvo imatinib ter entrado em uso clínico. Com base nos resultados dos estudos clínicos disponíveis, recomenda-se actualmente que os pacientes com risco intermédio ou elevado de recidiva recebam terapia adjuvante com o medicamento visado imatinib após a cirurgia. Em termos de duração do tratamento, recomenda-se actualmente a terapia imatinibular adjuvante durante 2 anos após a cirurgia para doentes de risco intermédio e 3 anos para doentes de alto risco. Contudo, observou-se clinicamente que em pacientes de alto risco, mesmo após 3 anos de tratamento pós-operatório com adjuvante imatinibular, os pacientes continuam a ter uma recaída seis meses após terem parado o medicamento. Um estudo dos EUA está a explorar a eficácia do imatinibe oral contínuo (400mg/d) durante 5 anos após a cirurgia. Além disso, estudos demonstraram que a eficácia do tratamento adjuvante com imatinibe varia entre pacientes com diferentes tipos de mutação genética, e os testes genéticos são recomendados para pacientes com expressão CD117 negativa. A recomendação actual para a terapia de imatinibração pós-operatória é de 400mg uma vez por dia. As opiniões sobre quando começar a terapia adjuvante diferem muito entre académicos europeus e americanos e académicos nacionais, que acreditam que o medicamento deve ser iniciado o mais cedo possível após a cirurgia. Na China, é geralmente recomendado esperar até os pacientes poderem comer normalmente e começar a tomar o medicamento 10-14 dias após a cirurgia para os pacientes que tiveram a maior parte do estômago removido, e 5-7 dias após a cirurgia para os pacientes que tiveram o cólon e segmentos do intestino delgado removidos.