Há provas de que os sais de lítio, valproato, carbamazepina e paroxetina estão associados a um risco de malformação fetal e devem, portanto, ser evitados no primeiro trimestre de gravidez. O problema mais significativo com os sais de lítio é o risco de malformações cardiovasculares, com uma incidência de aproximadamente 1,2-7,7%, sendo a insuficiência valvar tricúspide (Ebstein Anamoly) a mais grave, embora a taxa de risco absoluto seja muito baixa (1/1000). O risco de defeitos de desenvolvimento do tubo neural está principalmente associado ao valproato e à carbamazepina, especialmente o valproato, que pode ocorrer em até 6% dos casos. A lamotrigina é relativamente segura, embora dados recentes sugiram que pode estar associada a lábio leporino/palato fendido. Há pouca informação disponível sobre antipsicóticos atípicos, todos eles classificados pela FDA como de Categoria C (ou seja, os riscos não podem ser excluídos). Todas as avaliações de risco actuais de antidepressivos são também classificadas como C (excepto paroxetina e bupropiona); a paroxetina deve ser evitada durante a gravidez devido à sua possível associação com malformações cardiovasculares neonatais, enquanto a bupropiona é classificada como B (não há evidência de risco nos humanos) e, portanto, pode ser uma prioridade se os antidepressivos forem necessários durante a gravidez. Evitar também benzodiazepinas nas primeiras 10 semanas de gravidez (devido ao risco de harelip/ paladar esquerdo). Se ocorrer uma recaída de perturbação afectiva durante os primeiros 3 meses de gravidez, utilizar, se possível, tratamento psicossocial não farmacológico. Se o risco de recorrência da doença for maior do que o risco teratogénico dos medicamentos de tratamento, a terapia electroconvulsiva modificada (MECT) ou medicação deve ser considerada para controlar os episódios de humor. A escolha das opções de tratamento para as diferentes fases da gravidez deve basear-se nos potenciais efeitos adversos do medicamento. Por exemplo, para episódios maníacos agudos no primeiro trimestre, um antipsicótico atípico de classe C é apropriado, enquanto que para episódios depressivos bipolares, MECT ou quetiapina é apropriado. Embora outros antidepressivos possam ser considerados, tais como bupropion ou SSRIs (excepto paroxetina), é necessária uma combinação de antipsicóticos atípicos para reduzir o risco de conversão à mania. Como a gravidez aumenta a taxa de volume de líquidos na mulher grávida, a medicação deve ser aumentada a meio da gravidez para assegurar níveis sanguíneos estáveis e eficácia, mas reduzida nos dias que antecedem o parto para evitar efeitos tóxicos. Os pacientes devem ser informados do aumento do risco de morte fetal, retardamento do crescimento fetal, e toxicidade neonatal associada ao uso de drogas psicotrópicas em gravidezes médias a tardias. Além disso, foi relatado que o uso de valproato durante a gravidez foi associado a um menor desenvolvimento de QI verbal em crianças.