Em primeiro lugar, é de notar que existem riscos associados a qualquer cirurgia. A cirurgia cardíaca é um dos procedimentos cirúrgicos mais difíceis devido à necessidade de apoio à circulação extracorpórea e à necessidade de paragem cardíaca durante a cirurgia. Como resultado, os riscos da cirurgia são maiores do que os de outras especialidades. No entanto, o nível académico e técnico global da cirurgia cardíaca melhorou. Nos hospitais onde a cirurgia cardíaca é realizada rotineiramente, este procedimento torna-se rotineiro e os riscos da cirurgia são relativamente baixos e controlados. No entanto, o tratamento cirúrgico da doença pré-cardíaca ainda está sujeito a complicações tais como acidentes anestésicos, acidentes de circulação extracorporal (incluindo embolia aérea, trombose, paragem cardíaca, etc.), alergias a medicamentos, mecanismos de coagulação deficientes, tamponamento pericárdico, perturbações ambientais internas tais como água, electrólitos e metabolismo difíceis de corrigir, rouquidão, asfixia, doença celíaca, shunts residuais, regurgitação de várias válvulas, várias arritmias severas, bloqueio atrioventricular, etc. As hipóteses de ocorrência destas complicações cirúrgicas são pequenas, mas sempre que possível, o cirurgião aconselhará os pais da criança antes do início da cirurgia.