A patogénese do cancro da vesícula biliar, tal como outros tumores, ainda não foi totalmente compreendida. Contudo, a ocorrência de cancro da vesícula biliar está intimamente relacionada com algumas doenças benignas do tracto biliar, tais como pedras na vesícula biliar, adenoma da vesícula biliar e confluência anormal dos ductos biliopancreáticos. Acredita-se amplamente que os cálculos da vesícula biliar são um importante factor de risco para o cancro da vesícula biliar. Dados domésticos relataram que quase metade dos doentes com cancro da vesícula biliar têm pedras na vesícula biliar ao mesmo tempo, e alguns estudos mostraram que o risco de cancro da vesícula biliar para doentes com pedras na vesícula biliar é cerca de dez vezes maior do que o de pedras não vesiculosas, e quanto maiores forem as pedras, maior é a probabilidade de cancro da vesícula biliar. Quanto maior for a pedra, maior é o risco de cancro da vesícula biliar. O risco de cancro da vesícula biliar é cinco a seis vezes maior para os que têm pedras maiores do que 2 cm do que para os que têm pedras menores do que 1 cm. Além disso, a colecistite crónica de longa duração combinada com a calcificação da parede da vesícula biliar, que é chamada “vesícula biliar de porcelana”, também tem uma taxa de cancro mais elevada. Com cada vez mais exames de saúde, a proporção de lesões semelhantes a pólipos da vesícula biliar está também a aumentar, a maioria destes “pólipos da vesícula biliar” são múltiplos pólipos de colesterol, que não são tumores “reais” e geralmente não causam cancro. Se for um único pólipo, o seu tamanho for superior a 1cm, achatado e espessado, há mais hipóteses de carcinoma, que deve ser considerado como lesões pré-cancerosas e deve ser tratado precocemente.