Não existem métodos ou medicamentos especiais para a auto-cura do septo atrial pediátrico. Se a criança tiver menos de duas semanas e tiver um pequeno defeito do septo, é possível que a criança se cure a si própria, de facto, depende da criança crescer e fechar por si própria, não há nenhum medicamento especial. Contudo, há alguns pequenos problemas que precisam de ser notados, por exemplo, as crianças com defeitos do septo atrial são propensas a constipações e os resfriados podem facilmente transformar-se em pneumonia se não forem tratados a tempo, o que pode causar danos ao corpo da criança. Portanto, se uma criança for diagnosticada com defeito do septo atrial por ultra-som cardíaco, é importante certificar-se de que a criança evita ficar constipada e gripada, adicionar e remover roupas de acordo com o tempo para evitar apanhar uma constipação, e procurar assistência médica imediatamente após apanhar uma constipação. Além disso, é importante rever o ultra-som cardíaco regularmente, geralmente uma vez a cada 3-6 meses.