Como a maioria dos pais e professores não sabe muito sobre doenças cardíacas congénitas, a maioria das crianças com doenças cardíacas congénitas são limitadas na sua participação na actividade física. Isto é, na verdade, incorrecto. Uma certa quantidade de exercício é boa para o coração, e durante um exercício extenuante, a saída do coração é 4-5 vezes superior ao normal. As crianças com doença cardíaca precoce não cianótica assintomática podem frequentar aulas de educação física como habitualmente sem restringir os desportos recreativos e competitivos. Isto porque a restrição excessiva das actividades destas crianças não só afecta o seu desenvolvimento físico, como também aumenta a carga psicológica sobre os pais e as crianças. Alguns dos desportos mais adequados para eles são a corrida, saltar à corda ou saltar com elástico, shuttlecock, ténis de mesa e ginástica, mas não devem participar em desportos extenuantes como o basquetebol, futebol ou natação para evitar o excesso de esforço. As crianças com doença cianótica pré-cardíaca (por exemplo, Tetralogia de Fallot) e doença cardíaca grave devem limitar a quantidade de exercício a exercícios menos extenuantes que sejam adequados à vida diária e evitar sobrecarregar o coração tanto quanto possível. As crianças com doenças cardíacas pré-existentes que sofrem de aperto significativo do peito, tonturas, palidez, falta de ar e queda da pressão arterial durante o exercício devem parar imediatamente de se exercitar e procurar atenção médica de um cardiologista o mais depressa possível. Contudo, como as crianças individualmente têm padrões diferentes, é melhor que os pais consultem um cirurgião cardíaco antes de decidirem se o seu filho com doença cardíaca congénita pode participar em desportos.