Factores genéticos (mutações genéticas), factores físico-químicos (exposição a herbicidas, rodenticidas, tricloroetileno, triclorometano, radiação, partículas respiráveis, PM10, dióxido de azoto, monóxido de carbono, ozono), hábitos de vida adversos durante a gravidez, tais como abuso de álcool, tabagismo e tabagismo passivo, factores biológicos (infecções virais no início da gravidez, tais como toxoplasmose, vírus da rubéola, citomegalovírus, vírus do herpes simples, vírus do coxsackie e Microvírus), factores farmacológicos (medicamentos antiepilépticos, antidepressivos, inibidores de enzimas conversoras de angiotensina), factores psicológicos e médicos (a estimulação mental extrema da mãe ou a estimulação prolongada durante a gravidez também podem causar anomalias cardíacas no embrião).