Na prática clínica a fístula anal e a cirurgia das hemorróidas podem ser feitas em conjunto. Se a ferida for grande, o paciente é aconselhado a submeter-se a cirurgia sob anestesia lombar ou geral. A fístula é principalmente uma remoção da abertura interna e da fístula. As hemorróidas são principalmente removidas das hemorróidas externas e internas. É tido o cuidado de proteger o esfíncter anal para evitar danos excessivos no esfíncter anal, que poderiam levar à incontinência sensorial ou ao funcionamento anormal do intestino. A fístula anal e a cirurgia de hemorróidas podem ser relativamente invasivas, pelo que é importante alterar a medicação e o tratamento anti-inflamatório para evitar a infecção numa fase posterior. Pode optar por utilizar internamente os Supositórios de Hemorróidas Pudgicas, juntamente com a Pomada Dourada, a Pomada de Hemorróidas Almiscarada e a Gaze de Pomada Vermelha no exterior. O corte pós-operatório da granulação é necessário para ajudar a cicatrizar melhor a ferida.