As úlceras duodenais não precisam de ser biopsiadas porque não são cancerosas e o objectivo de uma biopsia é determinar se existe algum cancro. Além disso, as paredes do duodeno são muito finas e existe um elevado risco de perfuração se for feita uma biópsia ou outro tratamento. Apenas uma pequena percentagem de úlceras gástricas se tornam cancerosas. O cancro ocorre na extremidade da úlcera e a taxa de cancro é inferior a 1%. A biopsia está contra-indicada quando há hemorragia de uma úlcera gástrica, uma vez que pode agravar a hemorragia. Tanto as úlceras duodenais como as úlceras gástricas requerem tratamento regular sob a orientação de um gastroenterologista, especialmente no caso de úlceras duodenais, que são propensas a complicações tais como hemorragias, perfuração e obstrução, pelo que é importante que a medicação regular seja administrada em conjunto com o médico.