O princípio do rastreio auditivo do recém-nascido é a emissão otoacústica e a resposta auditiva do tronco cerebral.
1) Emissão otoacústica: O processo de entrada das ondas sonoras no ouvido interno é utilizado para determinar se o som gerado na cóclea consegue atravessar a estrutura do ouvido médio, penetrar no tímpano e fazer com que as células ciliadas reflictam a energia e, através da deteção da energia reflectida, é possível determinar se existe alguma lesão auditiva.
2) Resposta auditiva do tronco cerebral: Se um recém-nascido ouvir um som proveniente dos auriculares, o sistema nervoso responderá e a resposta será registada no monitor. Se essa resposta for registada, o teste de audição é considerado positivo; se não for registada, o teste de audição é considerado negativo.
Se um recém-nascido falhar o rastreio auditivo, é importante repetir o exame ou fazer uma avaliação auditiva completa, e é aconselhável consultar o médico em causa sobre o passo seguinte no processo de tratamento.