Em geral, é o nefrologista que é incapaz de confirmar o diagnóstico de doença renal através de análises de sangue, urina e ultra-sons, ou que confirmou clinicamente o diagnóstico mas ainda não conhece a gravidade da lesão renal, e esta compreensão clara da condição determina se o médico irá implementar um plano de tratamento específico, o que por sua vez tem um impacto directo no prognóstico da doença. É nesta altura que o médico recomendará uma punção renal (patologia), a fim de obter um diagnóstico patológico da doença renal, que orientará o médico na avaliação do estado actual, na formulação do plano de tratamento mais adequado, e na previsão do resultado provável (prognóstico) a longo prazo. É geralmente aceite que as seguintes condições são indicações para a punção renal: 1. insuficiência renal aguda com causas pouco claras e maus resultados de tratamento; 2. proteinúria a longo prazo, hematúria e episódios de hematúria carnitica com causas desconhecidas; 3. síndrome nefrótica refratária (resistência hormonal, dependência hormonal e recidivas frequentes); 4. nefrite alérgica da púrpura e lúpus nefrite: condições graves e maus resultados de tratamento.