Num coração humano normal o sistema de coração esquerdo forma um circuito fechado em série com o sistema de coração direito. O sangue corre sequencialmente através do nosso corpo através do coração direito, da artéria pulmonar, do coração esquerdo e da aorta. Os pacientes com transposição completa da aorta têm uma malformação do coração durante a vida fetal, resultando na ligação do coração direito à aorta e do coração esquerdo à artéria pulmonar, formando dois loops paralelos relativamente independentes, com a saturação de oxigénio do sangue nos pulmões a ser elevada e a saturação de oxigénio do sangue nas artérias a ser baixa. A criança não sobreviverá se não houver tráfego entre a circulação pulmonar e a circulação corporal, pelo que todas as crianças vistas têm tráfego ao nível atrial, ventricular ou arterial. Os hematomas são graves se houver pouca troca de sangue entre as duas circulações principais, e menos graves se houver muita troca de sangue, mas há sinais de insuficiência cardíaca, tais como dificuldade de alimentação, falta de ar, transpiração excessiva e crescimento fraco. As crianças com ducto arterioso combinado podem ter uma maior saturação de oxigénio nos membros inferiores do que nos superiores devido à derivação da artéria pulmonar para a aorta, que pode ter uma cor um pouco mais púrpura. Os pacientes com suspeita de transposição das grandes artérias devem visitar o hospital para uma ecografia, radiografia torácica e ECG. O diagnóstico pode geralmente ser feito de forma definitiva por ecografia. Por vezes é necessária mais imagiologia e cateterização para compreender a pressão da artéria pulmonar, tamanho do coração esquerdo, etc. Se as duas circulações principais dependem do cateter arterial para a comunicação, deve ser evitado oxigénio para evitar o fecho prematuro do cateter arterial, e em casos de comunicação mínima entre as duas circulações principais, deve ser realizada uma cirurgia de emergência num grande centro médico. A transposição completa das grandes artérias, se não intervém, resulta em morte dentro de uma média de 3 a 19 meses de nascimento, com apenas alguns sobrevivendo aos 20 a 30 anos de idade. Não há outro tratamento eficaz para além da cirurgia, e os procedimentos incluem a inversão arterial e o túnel interno + conduta externa.