As quatro fases da patologia da pneumonia lobar são a fase congestiva, a fase hepática vermelha, a fase hepática cinzenta, e a fase dissipativa. As alterações patológicas são caracterizadas por congestão e edema do tecido pulmonar durante a fase congestiva e exsudação do plasma nos alvéolos; a fase hepática vermelha é dominada pela infiltração dos glóbulos vermelhos; a área hepática cinzenta é dominada pela infiltração dos leucócitos; e depois os leucócitos fagocitam as bactérias e entram na fase dissipativa, onde o exsudado de fibrina é dissolvido e absorvido e os alvéolos são re-insuflados para restaurar o tecido pulmonar normal. A pneumonia lobar, vista na imagem clínica, encontra-se nas fases hepática vermelha e hepática cinzenta, nas quais as fases patológicas não são de facto demarcadas com precisão, e com a aplicação precoce de terapia antimicrobiana, esta fase patológica típica tornou-se rara. O prognóstico da pneumonia lobar é bom, e a estrutura do tecido pulmonar é, na sua maioria, intacta após a dissipação das lesões, não deixando cicatrizes fibrosas. Apenas muito poucos pacientes têm absorção incompleta de fibrina nos alvéolos, ou mesmo formação de fibroblastos, deixando uma pneumonia mecanizada.