Os efeitos da fissura palatina nos pacientes existem em duas áreas principais: 1) os pacientes com fissura palatina têm uma fissura anormal no palato superior, que afecta a morfologia; 2) os pacientes são incapazes de desempenhar funções fisiológicas normais tais como sugar, engolir, e falar. Nos lactentes, se são incapazes de sugar normalmente, também são incapazes de comer normalmente. Se os pais descobrirem que o seu filho tem o palato fendido, é importante procurar cuidados médicos precoces e obter aconselhamento sobre alimentação e cuidados sob a orientação do médico, de modo a assegurar o desenvolvimento físico da criança e a poder obter um melhor físico antes do momento da cirurgia. Devido ao facto de não haver fecho do palato, a criança é propensa a asfixia e tosse devido à regurgitação das cavidades oral e nasal durante a alimentação. Isto pode causar pneumonia por aspiração a longo prazo, resultando num maior risco de infecções respiratórias. Portanto, se uma criança tiver uma fissura palatina, espera-se que os pais levem a criança ao médico a tempo de reparar a fissura palatina o mais cedo possível no momento certo, para que a função fisiológica normal da criança possa ser restaurada.