O ozono tem um poder oxidante muito forte e um potencial de redução muito elevado e pode oxidar certas cadeias insaturadas na estrutura dos tecidos biológicos. O teor mais elevado de proteoglicanos encontra-se no núcleo pulposo (NPS) do disco intervertebral, que é de 40C60% do peso seco do NPS. O ozono pode oxidar especificamente os proteoglicanos no núcleo pulposo dos discos intervertebrais, decompondo-os assim, levando a uma diminuição da pressão osmótica nos discos, e a uma desidratação e solidificação do núcleo pulposo, aliviando assim a pressão dos discos herniados sobre as raízes nervosas; os próprios proteoglicanos são uma espécie de “substâncias estranhas”, que podem estimular reacções imunitárias. O ozono oxida especificamente os proteoglicanos, eliminando as substâncias imunogénicas; além disso, o ozono tem efeitos anti-inflamatórios e analgésicos, eliminando a inflamação química e imunológica. Se o anel fibroso for rompido, o ozono pode difundir-se no espaço epidural e no espaço paravertebral, onde pode ter um efeito mais amplo.