Se uma mulher procura uma biópsia cervical para verificar a infeção por HPV, o teste HPV isolado é mais preciso. Isto deve-se ao facto de a biópsia cervical apenas recolher tecido cervical da área da lesão, pelo que não é possível testar todo o tecido do colo do útero, pelo que o vírus HPV pode não estar claramente distribuído na área onde a biópsia é efectuada e não ser detectada uma infeção clara pelo HPV na biópsia, pelo que é possível que não sejam encontradas células de pectus excavatum na biópsia cervical e que não sejam detectados outros problemas anormais, mas que ainda exista uma infeção pelo vírus HPV a infeção pelo vírus HPV ainda está presente. Por isso, quando uma mulher precisa de ser testada para a infeção pelo HPV, o diagnóstico não deve ser confirmado por biópsia, mas sim por HPVDNA ou cariotipagem do HPV. A biopsia cervical é realizada para detetar a presença de lesões cervicais, mais frequentemente neoplasia intra-epitelial cervical e mesmo cancro cervical, que devem ser diagnosticadas por biopsia, ao passo que o HPV apenas detecta a infeção pelo HPV e não as lesões cervicais. Assim, se uma mulher quiser apenas testar a infeção por HPV, não é normalmente necessária uma biópsia, sendo suficiente um simples teste de HPV, mas se estiver a verificar se há problemas de lesões cervicais, deve ser feita uma biópsia.