Se uma fístula anal for deixada sem tratamento, pode de facto levar ao cancro, embora as hipóteses não sejam muito elevadas, de acordo com dados clínicos, há uma taxa de cancro de 5% em 10 anos para uma grande raiz. As razões pelas quais as fístulas anais se tornam cancerosas incluem o seguinte: em primeiro lugar, estimulação inflamatória crónica: a presença de inflamação prolongada devido a fístulas anais não tratadas torna possível a descarga de substâncias purulentas e fezes da fístula, estimulando assim a proliferação de células anormais e levando a lesões malignas. Em segundo lugar, a presença a longo prazo de bactérias na fístula, especialmente Pseudomonas aeruginosa ou infecções por Mycobacterium tuberculosis, também pode levar a fístulas cancerosas. Muitas pessoas com fístulas anais tomam muitos medicamentos durante muito tempo, e estes medicamentos estimulam frequentemente a área local, levando a lesões e a uma tendência para as fístulas anais se tornarem cancerosas. A maioria dos doentes com fístulas anais são adenocarcinoma mucoso, e a formação de nós duros, secreção de muco e dor são frequentemente os precursores do cancro, pelo que as pessoas devem prestar muita atenção a isto. O facto real é que poderá obter muito mais do que apenas alguns destes. O facto real é que encontrará muitas pessoas que não são capazes de obter um bom negócio sobre isto.