Parece impossível dizer que a medida mais segura para eliminar o risco de infecção genital por HPV é evitar qualquer contacto genital com outra pessoa! Deve-se dizer que para as mulheres sexualmente activas, manter uma relação regular a longo prazo com o parceiro sexual é uma medida eficaz para maximizar a prevenção da infecção genital por HPV. No entanto, mesmo assim, ainda é difícil saber se um parceiro sexual já foi infectado antes. O papel dos preservativos na prevenção da infecção por HPV não é claro, uma vez que as áreas não cobertas pelos preservativos podem ser infectadas pelo vírus. Embora o papel dos preservativos na prevenção da infecção por HPV não seja claro, parece que a medida mais simples e mais eficaz actualmente é usar preservativos. Deve-se notar que o efeito protector do uso de preservativos é mais benéfico para as mulheres! Estudos têm descoberto que a utilização de preservativos leva a uma redução da incidência de cancro do colo do útero, cuja principal causa é a infecção por HPV. A FDA americana aprovou duas vacinas contra a infecção por HPV, Gardasil® e Cervarix®, que são eficazes na prevenção da infecção persistente com os tipos 16 e 18 de HPV, os dois tipos que causam 70% dos cancros cervicais. O Gardasil também protege contra ambos os tipos HPV 6 e 11, que estão associados a quase todas as verrugas genitais (90%). Existem algumas descobertas iniciais de que Cervarix também fornece protecção parcial contra outros tipos de HPV que podem causar cancro.