Cirurgia: 50% das crianças com hidrocefalia congénita têm uma remissão natural entre os 2 e 5 anos de idade e são referidas como tendo hidrocefalia estática, que pode não necessitar de tratamento. Os restantes 50% das crianças com hidrocefalia progressiva, com um crânio significativamente aumentado e uma espessura cortical de mais de 1 cm, podem ser tratadas cirurgicamente. Electrocauterização para reduzir a secreção do líquido cefalorraquidiano, etc. Se a causa não puder ser corrigida e o tratamento medicamentoso for ineficaz, podem ser usadas shunts de fluido cerebrospinal intracraniano ou extracraniano, dependendo da lesão e do local de obstrução, com shunts intracranianos normalmente utilizados, tais como a drenagem da piscina medular ventriculocerebelar e a tripla ventriculostomia.