A fístula é caracterizada por uma abertura interna no seio anal, que passa através dos tecidos perianal e rectal, e uma abertura externa na pele perianal, onde as secreções purulentas fluem frequentemente da abertura externa, causando inchaço local e dor sempre que a abertura externa se fecha. A razão da dificuldade de cura é a seguinte: 1. o porto interno e os focos primários de infecção continuam a existir, embora o abcesso seja incisado e drenado, os focos primários de infecção, criptites anais e infecção da glândula anal ainda existem, e o conteúdo intestinal também pode continuar a entrar através do porto interno. A fístula pode ser aberta e drenada a diferentes alturas, mas a lesão primária infectada da fossa de safena anal e a infecção das glândulas anais ainda existe, e o conteúdo do intestino pode continuar a entrar através da abertura interna. A fístula passa através do esfíncter anal em diferentes alturas e os estímulos inflamatórios locais podem causar espasmo do esfíncter anal, impedindo a drenagem do pus da luz e afectando negativamente a cura da fístula. 4. a abertura externa é estreita, por vezes fechada e por vezes colapsada, e a má drenagem da cavidade do pus pode levar à recorrência do abcesso e à penetração da pele para formar um novo ramo.