Não há forma de diagnosticar depressão com um EEG na situação actual. Se houver alguma anormalidade no EEG, este só pode ajudar a determinar se existe um problema, uma manifestação de depressão, tal como a presença de ondas alfa no EEG, especialmente um EEG de baixo funcionamento. Pode ser porque a depressão tem uma actividade cerebral mais fraca, pensamento mais lento, fraca concentração e falta de excitação cerebral. Não é o desempenho do EEG que pode determinar ou confirmar o diagnóstico de depressão, o EEG só pode ser usado como critério auxiliar para identificar a depressão. O diagnóstico de depressão ainda se baseia principalmente em sintomas clínicos, desempenho e testes psicológicos. Se houver certos sinais de depressão, um EEG deve ser examinado para excluir a depressão causada por uma série de desordens orgânicas, tais como epilepsia e traumatismo cerebral.