Autoanticorpos são imunoglobulinas que visam proteínas ou componentes celulares que ocorrem normalmente no corpo. O crescimento, desenvolvimento e sobrevivência do corpo dependem da manutenção de um mecanismo de tolerância autoimune intacto, e uma resposta imunitária normal é protectora e defensiva, ou seja, não reage aos seus próprios tecidos e componentes. Uma vez comprometida a integridade do mecanismo de auto-tolerância, o corpo verá os seus próprios tecidos e componentes como “estranhos” e ocorrerá uma resposta auto-imune, produzindo auto-anticorpos. Títulos baixos de auto-anticorpos podem estar presentes no sangue humano normal e nenhuma doença ocorrerá; no entanto, se os títulos de auto-anticorpos excederem um determinado nível, podem ocorrer danos no corpo e a doença pode ser desencadeada. A resposta auto-imune pode ser desencadeada de várias maneiras 1. Em circunstâncias normais o corpo limita estritamente a libertação de substâncias (antigénios escondidos) de um determinado local (isolados do sistema imunitário) para a circulação sistémica, por exemplo, o fluido atrial do olho está normalmente confinado ao globo ocular, mas quando o fluido atrial entra na corrente sanguínea durante o traumatismo ocular, o sistema imunitário reage ao mesmo 2. As substâncias do corpo normal são alteradas, por exemplo, vírus, drogas, luz solar ou radiação causam alterações na estrutura do 3. o sistema imunitário reage a substâncias estranhas que são semelhantes às suas próprias e trata erroneamente as suas próprias substâncias como estranhas. 4. as células que controlam a produção de anticorpos têm alguma função anormal, por exemplo linfócitos B cancerosos podem produzir anticorpos anormais que atacam os glóbulos vermelhos.