O melhor tratamento para a síndrome nefrótica depende do tipo de patologia renal. Se o tipo de patologia renal for microscópica, só é necessária terapia com glicocorticóides. No caso de nefropatia membranosa, é indicado o tratamento com doses adequadas de glicocorticóides combinadas com medicamentos imunossupressores adequados. A prednisona ou metilprednisolona são recomendadas para glucocorticóides, e o fármaco de eleição para imunossupressão é a ciclofosfamida; a ciclosporina ou o tacrolimus também podem ser considerados. Em alguns casos clínicos raros, medicamentos como o ralston ou leflunomida ou azatioprina também podem ser considerados. Claro que estes tratamentos requerem a exclusão da tuberculose, infecção e outras contra-indicações ao uso de glucocorticóides. São também necessários diuréticos sintomáticos, descongestionantes, anti-hipertensivos e anticoagulantes, tais como furosemida, comprimidos de libertação prolongada de nifedipina, valsartan ou Bactrim, warfarin, etc.