Quando uma infecção por micoplasma é diagnosticada no tracto urinário, é tratada com azitromicina e outros antibióticos macrolídeos tais como roxitromicina ou doxiciclina. A infecção é mais frequentemente causada por contacto sexual impuro. Após a infecção, pode haver micção frequente, urgência, micção dolorosa, queimadura e prurido na uretra, e um aumento da descarga da uretra, que pode ser uma descarga espessa, amarelada ou branca. É necessário um teste de cultura da descarga ou um teste de cultura de urina para confirmar o diagnóstico. Em princípio, o tratamento deve ser dado durante um período de pelo menos uma semana até que os sintomas do doente tenham desaparecido completamente e a urina ou a descarga seja completamente negativa antes que o medicamento possa ser parado. Se o paciente tiver um parceiro sexual, ambos os parceiros precisam de ser tratados em conjunto.