A disfunção hipotalâmica causa anovulação devido a uma diminuição da hormona libertadora de gonadotropina como resultado de sinais de entrada anormais do hipotálamo. Ocorre em mulheres jovens e está mais frequentemente associado a amenorreia hipogonadotrópica psicogénica. Vários estímulos anormais, incluindo a estimulação mental súbita, exercício extenuante, pânico excessivo, depressão, nervosismo e ânsia de ter uma criança levam à amenorreia. A anorexia psicogénica, a amenorreia simples de perda de peso e o exercício excessivo também podem levar a distúrbios endócrinos; doenças graves de desperdício sistémico ou desnutrição também podem causar anovulação e amenorreia. Caracteriza-se por anomalias directas e indirectas na secreção pulsátil de GnRH do hipotálamo, levando a uma secreção anormal de hormonas glandulares pituitárias, níveis diminuídos de FSH e LH, e o desaparecimento dos picos de LH, resultando em anovulação. 1. síndrome de Kallman: uma doença genética com baixas gonadotrofinas e hormonas sexuais, acompanhada de hiposmia ou ausência de olfacto. As principais manifestações são amenorreia primária, nenhum desenvolvimento de características sexuais ao atingir a idade pubertária, cariótipo normal, diferenciação normal dos ovários e genitais internos femininos, baixos níveis de gonadotropina, baixos níveis de estrogénio e progesterona, e nenhuma actividade funcional dos ovários. 2. anorexia nervosa: uma doença psiconeuroendócrina. As manifestações clínicas incluem amenorreia com vários graus de hipogonadismo, retracção do útero e dos ovários, e um acentuado desperdício. Doenças sistémicas: tais como desnutrição grave, obesidade excessiva, falta de vitaminas A, B e E na dieta podem afectar a função ovariana, doenças endócrinas metabólicas tais como hiper ou hipotiroidismo e diabetes grave podem afectar a função ovariana e levar à anovulação. 4. insuficiência luteal ou insuficiência luteal: causada pela quantidade insuficiente ou curta duração da secreção de progesterona do corpo lúteo ovariano. O tratamento para este tipo de distúrbio de ovulação envolve tratamento psiquiátrico e modificação do estilo de vida para restaurar a função hipotalâmico-hipófise-ovariana. Devido ao seu baixo perfil de gonadotropina, o tratamento com gonadotropina pode ser utilizado para induzir a ovulação naqueles que requerem fertilidade.