As fissuras anais podem ser tratadas bastante bem, uma vez que ocorrem principalmente em doentes jovens e de meia-idade. Para casos mais leves, o tratamento conservador pode ser escolhido tomando banhos diários ou banhos de sitz de água salgada, ajustando a dieta, comendo uma dieta razoável, comendo mais vegetais e fibras grosseiras, e idealmente habituando-se a ir para a cama e a ter movimentos intestinais a tempo. Evite beber álcool, não se esforce, não fique acordado até tarde, e faça exercício físico para melhorar os seus sintomas. Em casos graves de fissuras anais que afectam a sua vida diária e o seu trabalho, pode optar pelo tratamento cirúrgico removendo a superfície ulcerada da fissura com anestesia local ou epidural. Se houver uma combinação de hemorróidas, estas também devem ser tratadas em conjunto. Após a cirurgia, a medicação deve ser trocada regularmente para promover a cura, e após cada movimento intestinal, devem ser tomadas limpezas e banhos de sitz para prevenir infecções.