O tratamento das fissuras anais é um pouco mais fácil do que o das hemorróidas. Se a fissura for aguda, o tratamento conservador com medicamentos pode curar a fissura e curá-la. Mesmo no caso de fissuras crónicas, se o tratamento conservador com medicação não for eficaz, a cirurgia pode eventualmente ser utilizada para curar a fissura. A cirurgia é muito mais simples do que para as hemorróidas, uma vez que a fissura e os apêndices são simplesmente removidos e parte do esfíncter interno é cortado para garantir que não há recidiva após a cirurgia. A fase inicial das hemorróidas é geralmente tratada de forma conservadora com medicamentos, mas se o paciente não prestar atenção à sua dieta, movimentos intestinais e hábitos de vida, as hemorróidas podem continuar a piorar. Em casos graves, isto pode levar a hemorróidas mistas circulares, e a cirurgia é muito mais difícil em comparação com as fissuras anais.