As fissuras anais não requerem necessariamente cirurgia. A maioria das fissuras anais são tratadas de forma conservadora, ou seja, não cirúrgica, como a correcção da obstipação primária, diarreia ou medicação tópica para parar a dor e a hemorragia. A cirurgia pode ser considerada para fissuras crónicas, fissuras de fase III ou quando o tratamento conservador não é eficaz. O tratamento das fissuras anais é principalmente sintomático, aliviando os sintomas e eliminando a causa da fissura. Além disso, os pacientes também podem usar medicação laxante ou dor tópica e medicação hemostática sob supervisão médica. Para fissuras anais crónicas ou fissuras de fase III, o tratamento cirúrgico é a base, incluindo a excisão da fissura e a excisão lateral do esfíncter interno. Os pacientes são aconselhados a comer mais vegetais, frutas e outros alimentos fibrosos, beber mais água e evitar alimentos picantes e estimulantes. Manter também o ânus limpo e evitar tensões excessivas durante a defecação. Qualquer obstipação ou diarreia deve ser prontamente corrigida.