A proteína da urina com três sinais mais não significa necessariamente nefrite. A proteína da urina pode ser vista na glomerulonefrite crónica, glomerulonefrite aguda e outras doenças renais, mas também em infecções do tracto urinário. Para além das infecções do tracto urinário, a proteína da urina pode também manifestar-se como sangue oculto da urina e leucócitos positivos da urina. Clinicamente, pode haver sintomas de frequência, urgência, micção dolorosa ou arrepios, febre, dor na zona renal unilateral ou bilateral, que são melhores para o diagnóstico diferencial. Para além das infecções do tracto urinário, a proteína da urina também pode ser vista em certas doenças sistémicas como o mieloma múltiplo, diabetes mellitus e lúpus eritematoso sistémico, todas elas podendo levar a danos renais e assim produzir proteína da urina.