As principais causas de icterícia do leite materno incluem o seguinte: em primeiro lugar, é causada por uma quantidade insuficiente de leite materno que está a ser produzido. Nos primeiros dias de vida, existe uma grave falta de produção de leite materno, o que pode causar icterícia do leite materno. Se a quantidade de leite materno for insuficiente, pode causar muito pouca formação de fezes no intestino da criança, causando um aumento da circulação hepática e intestinal de bilirrubina nos intestinos. Quando a circulação hepática e intestinal da bilirrubina aumenta, o nível de bilirrubina no sangue aumenta significativamente, causando icterícia do leite materno. Em segundo lugar, é afectado pelas enzimas do leite materno. Isto porque o leite materno contém beta glucuronidase, que converte a bilirrubina conjugada no intestino em bilirrubina não conjugada, que é depois reabsorvida na corrente sanguínea, causando um aumento dos níveis de bilirrubina e resultando em icterícia do leite materno.