Os quistos das glândulas salivares podem ser removidos injectando 0,2-0,5 ml de 2% de tintura de iodo na cavidade cística depois de o líquido cístico ter sido aspirado e deixado durante 2-3 minutos antes de a tintura de iodo ser retirada, com o objectivo de destruir as células epiteliais para que percam a sua função secreta e não se formem mais quistos. Os pequenos quistos da mucosa da glândula salivar são geralmente removidos sob anestesia de infiltração local, cortando a mucosa longitudinalmente e separando a parede do cisto romba ou bruscamente sob a mucosa, fora da parede do cisto, com danos mínimos no tecido glandular circundante, e a glândula ligada ao cisto deve ser removida juntamente com o cisto para evitar a sua recorrência. Os quistos das glândulas mucosas repetidamente feridos podem formar uma cicatriz e aderir à parede do cisto, que não é facilmente separada. Nesses casos, pode ser feita uma incisão em ambos os lados do cisto para remover a cicatriz, o cisto e os seus tecidos adjacentes juntos, e a ferida pode ser fechada directamente. Os quistos sublinguais das glândulas são tratados através da remoção da glândula sublinguais e do quisto.