Os cistos mesentéricos não são uma doença muito grave na prática clínica porque, como o nome indica, os cistos são quase sempre benignos na prática clínica, e os cistos mesentéricos são também benignos, o que significa que não há recorrência ou metástase de doenças malignas. Em termos de sintomas da doença, é provável que os cistos mesentéricos não apresentem sintomas clínicos óbvios na maioria dos casos, podendo apenas aparecer como uma massa abdominal quando aumentam de tamanho, ou mesmo comprimem o canal intestinal e causam desconforto abdominal, o que é detectado no momento da consulta. Em termos de tratamento e prognóstico, se um cisto mesentérico é tratado com medicação é geralmente ineficaz e a única maneira de o curar é removê-lo cirurgicamente. Após a remoção cirúrgica de um cisto mesentérico, normalmente não há possibilidade de recorrência local ou metástase, o que significa que a vida do paciente não é afectada a longo prazo, pelo que os cistos mesentéricos não são uma doença muito grave.