Existem muitas causas de desconforto gastrointestinal, e as causas mais comuns encontram-se nas seguintes categorias: 1. causadas pela dieta, por exemplo, muitas pessoas sentem desconforto gastrointestinal, como inchaço, dor abdominal, ou mesmo náuseas e vómitos, depois de comerem alimentos frios, gordurosos ou picantes. 2. doenças gastrointestinais funcionais, principalmente a gastroscopia não apresenta quaisquer anomalias, enquanto que existem sintomas de indigestão e desconforto gastrointestinal. 3. lesões benignas, tais como Gastrite, úlcera gástrica, erosão gástrica, pólipos gástricos, pólipos intestinais, enterite e outras doenças. Além disso, as lesões malignas do estômago e dos intestinos podem também apresentar sintomas de desconforto gastrointestinal, tais como cancro do estômago, cancro do intestino, linfoma, etc.