Em geral, a causa do mau hálito deve primeiro ser identificada e a medicação apropriada deve ser administrada de acordo com a causa.
Se o mau hálito for causado por uma infecção focalizada na boca, podem ser prescritos antibióticos, etc., além do tratamento especializado apropriado em odontologia; se o mau hálito for causado por infecção por Helicobacter pylori, os medicamentos comuns incluem a terapia quádrupla, incluindo inibidores da bomba de protões, antibióticos e bismuto; se o mau hálito for causado por uma doença sistémica, como a diabetes, os medicamentos comuns são medicamentos orais com baixo teor de glucose-baixo ou insulina, etc.