Se os nódulos epidídimos não forem tratados, desaparecem geralmente após 2-3 meses. Os próprios nódulos epidídimos são uma espécie de alteração esclerótica produzida após a epididimite e pertencem a uma estrutura semelhante a uma cicatriz. Quando a epididimite é tratada, alguns tecidos necróticos permanecerão na área da inflamação, que pode aparecer isolada ou em aglomerados. Se esta condição não for tratada e metabolizada apenas pelo sistema auto-imune, normalmente demora cerca de 2-3 meses a ser gradualmente digerida e absorvida, o que é relativamente lento. Se estiver preocupado ou quiser fazê-lo desaparecer rapidamente, pode escolher a cirurgia para remover os nódulos para o fazer desaparecer rapidamente. Se não quiser ser operado, pode também optar por aplicar toalhas quentes para promover a circulação sanguínea local, para acelerar o recuo dos nódulos. Além disso, recomenda-se que os pacientes não tenham relações sexuais frequentes antes que o nódulo epidídimo desapareça completamente, pois isso afectará a remissão do nódulo.