Os quistos ovarianos encontrados no início da gravidez devem ser avaliados quanto a benignidade ou malignidade, fazendo primeiro um teste tumoral de cinco itens. Se for maligna, a gravidez deve ser interrompida prontamente e tratada cirurgicamente. Se o cisto for considerado benigno e o cisto for maior que cinco centímetros, o desbridamento do cisto após 14 semanas de gravidez pode ser considerado e enviado para exame patológico e tratamento pós-operatório para assentar o feto. Se o quisto ovariano não for operado em meados do trimestre. À medida que o útero aumenta de tamanho, a cirurgia tornar-se-á difícil e deve ser feita para observação. Se houver sintomas de dor abdominal e o cisto ovariano for considerado torcido, rompido ou necrótico, a cirurgia deve ser feita prontamente. Durante o parto, se o quisto ovariano bloquear a descida da parte pré-natal do feto, o parto vaginal não pode ser realizado e é necessária uma cesariana.