Nos doentes com quistos espinais, existem dois tipos principais de quistos: primário e secundário. No caso dos quistos primários do canal raquidiano, muitas vezes são causados pelo desenvolvimento congénito, tais como anomalias congénitas da dura-máter ou a presença de células tumorais intra-durais durante o crescimento e desenvolvimento, que podem facilmente formar tumores ou quistos no canal raquidiano mais tarde, comprimindo assim a medula espinal e as raízes nervosas no canal raquidiano. Os cistos intravertebrais secundários estão associados a traumatismos ou infecções bacterianas. Neste caso, formou-se um hematoma local significativo na sequência de um trauma, ou existe uma infecção bacteriana de um órgão em qualquer outra parte do corpo. A bactéria entra na corrente sanguínea e depois entra no canal espinal, onde cresce e se multiplica, e mais tarde fica encapsulada em tecido normal, causando assim também a condição de um cisto intradural.