A intubação uretral masculina pode ser dolorosa até certo ponto, principalmente devido à fisiologia masculina, e está geralmente dentro de limites toleráveis. A uretra masculina é longa e tem três curvas, bem como duas curvas, três curvas na uretra interna, na membrana e na uretra externa, e duas curvas uma para a curva púbica inferior e a outra para a curva púbica anterior, que podem facilmente irritar ou danificar a mucosa e causar dor ao efectuar a intubação uretral. Se o doente estiver preocupado com dores graves ou for sensível à dor, o gel de cloridrato de lidocaína ou gel de cloridrato de oxicodona pode ser injectado na uretra. Para pacientes cirúrgicos, a intubação pode ser realizada sob anestesia e pode proporcionar um alívio significativo da dor. Se o doente tiver pedras, uma próstata aumentada e outras condições, o cateter uretral pode ser difícil de inserir e pode ser cateterizado com a ajuda de um dilatador uretral. Se necessário, deve ser utilizado um anestésico de superfície intra-uretral como o gel de hidrocloreto de oxibutinina para aliviar a dor do doente. Quando um cateter urinário precisa de ser deixado no lugar, deve ser dada atenção aos cuidados locais, à limpeza regular, tal como solução diluída de iodophor ou permanganato de potássio, e à aplicação de antibióticos para prevenir a infecção. É por isso que a intubação uretral masculina pode ser dolorosa, mas a maioria dos pacientes pode tolerá-la e certas medidas podem ser tomadas para aliviar a dor, o que por sua vez leva à introdução suave do tubo uretral e permite que o paciente melhore os seus problemas urinários.