Se for encontrado um cisto ovariano correcto durante a gravidez inicial, o tratamento específico pode ser decidido de acordo com o tamanho e natureza do cisto e os sintomas. Se o próprio quisto ovariano for benigno, menos de 5cm, e a sua taxa de crescimento for lenta na revisão, pode ser acompanhado e não requer medicação ou cirurgia, uma vez que a gravidez é um momento especial para evitar medicação e cirurgia. No entanto, se o cisto ovariano for maior que 5cm ou se a taxa de crescimento for particularmente rápida na revisão, recomenda-se normalmente a cirurgia entre 14 e 16 semanas de gravidez para remover o cisto se o feto estiver estável e não houver sinais de pré-eclâmpsia, de modo a evitar a ruptura ou torção do cisto nas fases médias ou tardias da gravidez. Se o próprio quisto ovariano for de natureza maligna, a cirurgia deve ser realizada com urgência, seja durante a gravidez ou não.